chore: align sqlite control plane architecture

- replace default Convex control-plane wording with Rust SQLite control-plane across architecture, AGENTS, Reasonix, and design docs

- retire root Convex functions source and deploy script into recycle while keeping explicit cloud/compat/sync-replica boundaries

- add control-plane migration guard/docs and keep CodeGraph refreshed after the SQLite control-plane cutover

design/03-rust-web/done/3-3-rust-web-tree-realtime-event-stream-v1.md

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 不同 `WorkspaceSource` 使用不同 substrate：
 
 - `local_folder`：本地文件系统、watcher、rescan、命令执行结果。
-- `convex_workspace`：Convex 持久化、mutation / query、实时订阅、对象存储协作。
+- `convex_workspace`：显式 cloud / compat source 的 Convex 持久化、mutation / query、实时订阅、对象存储协作。
 
 Convex 在这里是可选云端 / 协作 source 的 substrate，而不是所有工作区的默认 substrate：
 
@@ -281,7 +281,7 @@ Rust Web 负责：
 - [x] WS handler 用 `tokio::select!` 订阅 `stream_delta_tx` broadcast channel，mutation 后推送 delta 给所有客户端。
 - [x] 2026-05-17 commit `57ec8322`：SSE pollMs=1000 polling 替换为 WebSocket push + SSE fallback。Convex idle 查询从 17/min 降至 0/min。
 - [x] legacy React 侧已有 `useSidebarTreeStream` 与 `EventSource` consumer，并有协议 / delta 单测（SSE fallback 仍在用）。
-- [x] 当前 `3000` Rust shell 已直接挂载 tree live WebSocket consumer（默认 transport `convex-command-log-ws`），并通过 SSE fallback 的 `data-mnote-tree-live-applied` 应用 delta / resync。
+- [x] 当前 `3000` Rust shell 已直接挂载 tree live WebSocket consumer；旧 `convex-command-log-ws` 命名只代表历史 transport 标签，默认 live cache 不再要求 Convex backend，并通过 SSE fallback 的 `data-mnote-tree-live-applied` 应用 delta / resync。
 - [x] `task112` / `task120` / `task123` 已覆盖 `/api/tree/events` snapshot、delta / resync 与 stream owner 可用性。
 - [x] `task165` 已验证双 pane 不重复建立第二条 tree live stream。
 - [x] 2026-05-16 复核确认 workspace snapshot 同时携带 `data.dataset.kernel_sidebar_projection` 与 `data.dataset.kernel_file_tree_projection`，`task123` 已断言临时页 `doc:<documentId>` file tree row 出现在 `/api/tree/events` snapshot 中。

design/03-rust-web/done/3-5-rust-web-main-execution-plane-cutover-plan-v1.md

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 - `3000` 保持唯一公开入口，不新增长期公开端口。
 - `mnote-web` 成为主 gateway、主 SSR shell、主 API transport、主 realtime transport 的 owner。
 - Next App Router 只能保留为内部 compat，负责尚未迁完的 legacy 页面或 React island bundle，不再新增长期业务语义。
-- Convex 保留为 storage / realtime substrate，不因为主 Web Rust 化而先拆。
+- Convex 保留为历史迁移源、显式 cloud source / compat / sync replica 边界；主 Web Rust 化后默认 storage / realtime / control-plane 不再依赖 Convex。
 - 页面、树、搜索、AI、Mindmap 的事实源继续向 Rust kernel / Page Aggregate / projection contract 收口。
 - `BlockNote` 保留为 fallback / 对照链，不作为主执行面迁移的阻塞项。